| Clarkia pulchella Pursh | | a | | Clarkia pulchella Pursh | | 100503 | |
| Clarkia unguiculata Lindl. | | a | | Clarkia unguiculata Lindl. | | 310108 | |
| Clarkia amoena (Lehm.) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. amoena | | a | i | Clarkia amoena (Lehm.) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. amoena | | 310182 | |
| Clarkia amoena (Lehm.) A. Nelson & J. F. Macbr. | | a | | Clarkia amoena (Lehm.) A. Nelson & J. F. Macbr. | | 310184 | |
| Clarkia xantiana A. Gray | | a | | Clarkia xantiana A. Gray | | 314807 | |
| Clarkia imbricata F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | | Clarkia imbricata F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314808 | |
| Clarkia purpurea (Curtis) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. quadrivulnera (Douglas ex Lindl.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia purpurea (Curtis) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. quadrivulnera (Douglas ex Lindl.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314809 | |
| Clarkia purpurea (Curtis) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. viminea (Douglas) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia purpurea (Curtis) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. viminea (Douglas) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314810 | |
| Clarkia purpurea (Curtis) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. purpurea | | a | i | Clarkia purpurea (Curtis) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. purpurea | | 314813 | |
| Clarkia purpurea (Curtis) A. Nelson & J. F. Macbr. | | a | | Clarkia purpurea (Curtis) A. Nelson & J. F. Macbr. | | 314814 | |
| Clarkia speciosa F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | | Clarkia speciosa F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314816 | |
| Clarkia speciosa F. H. Lewis & M. R. Lewis subsp. speciosa | | a | i | Clarkia speciosa F. H. Lewis & M. R. Lewis subsp. speciosa | | 314817 | |
| Clarkia speciosa F. H. Lewis & M. E. Lewis subsp. immaculata F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia speciosa F. H. Lewis & M. E. Lewis subsp. immaculata F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314818 | |
| Clarkia williamsonii (Durand & Hilg.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | | Clarkia williamsonii (Durand & Hilg.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314819 | |
| Clarkia amoena (Lehm.) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. huntiana (Jeps.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia amoena (Lehm.) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. huntiana (Jeps.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314821 | |
| Clarkia arcuata (Kellogg) A. Nelson & J. F. Macbr. | | a | | Clarkia arcuata (Kellogg) A. Nelson & J. F. Macbr. | | 314823 | |
| Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. sonomensis (C. L. Hitchc.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. sonomensis (C. L. Hitchc.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314825 | |
| Clarkia rubicunda (Lindl.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | | Clarkia rubicunda (Lindl.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314827 | |
| Clarkia virgata Greene | | a | | Clarkia virgata Greene | | 314829 | |
| Clarkia breweri (A. Gray) Greene | | a | | Clarkia breweri (A. Gray) Greene | | 314830 | |
| Clarkia concinna (Fisch. & C. A. Mey.) Greene | | a | | Clarkia concinna (Fisch. & C. A. Mey.) Greene | | 314832 | |
| Clarkia biloba (Durand) A. Nelson & J. F. Macbr. | | a | | Clarkia biloba (Durand) A. Nelson & J. F. Macbr. | | 314834 | |
| Clarkia cylindrica (Jeps.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | | Clarkia cylindrica (Jeps.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314836 | |
| Clarkia dudleyana (Abrams) J. F. Macbr. | | a | | Clarkia dudleyana (Abrams) J. F. Macbr. | | 314838 | |
| Clarkia rostrata W. S. Davis | | a | | Clarkia rostrata W. S. Davis | | 314840 | |
| Clarkia lewisii P. H. Raven & D. R. Parn. | | a | | Clarkia lewisii P. H. Raven & D. R. Parn. | | 314841 | |
| Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. | | a | | Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. | | 314842 | |
| Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. gracilis | | a | i | Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. gracilis | | 314844 | |
| Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. albicaulis (Jeps.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. albicaulis (Jeps.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 314845 | |
| Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. tracyi (Jeps.) Abdel-Hameed & R. Snow | | a | i | Clarkia gracilis (Piper) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. tracyi (Jeps.) Abdel-Hameed & R. Snow | | 314848 | |
| Clarkia spp. | | a | | Clarkia spp. | | 317005 | |
| Clarkia franciscana F. H. Lewis & P. H. Raven | | a | | Clarkia franciscana F. H. Lewis & P. H. Raven | | 400574 | |
| Clarkia elegans Douglas ex Lindl. | Clarkia unguiculata Lindl. | | | Clarkia elegans Douglas ex Lindl. | Clarkia unguiculata Lindl. | 404539 | 310108 |
| Clarkia amoena (Lehm.) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. lindleyi (Douglas) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia amoena (Lehm.) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. lindleyi (Douglas) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 412386 | |
| Clarkia springvillensis Vasek | | a | | Clarkia springvillensis Vasek | | 415747 | |
| Clarkia tembloriensis Vasek | | a | | Clarkia tembloriensis Vasek | | 416349 | |
| Clarkia tembloriensis Vasek subsp. tembloriensis | | a | i | Clarkia tembloriensis Vasek subsp. tembloriensis | | 416350 | |
| Clarkia tembloriensis Vasek subsp. calientensis (Vasek) K. E. Hols. | | a | i | Clarkia tembloriensis Vasek subsp. calientensis (Vasek) K. E. Hols. | | 416351 | |
| Clarkia calientensis Vasek | Clarkia tembloriensis Vasek subsp. calientensis (Vasek) K. E. Hols. | | | Clarkia calientensis Vasek | Clarkia tembloriensis Vasek subsp. calientensis (Vasek) K. E. Hols. | 416352 | 416351 |
| Clarkia bottae (Spach) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | | Clarkia bottae (Spach) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 433293 | |
| Clarkia rhomboidea Douglas | | a | | Clarkia rhomboidea Douglas | | 454229 | |
| Clarkia borealis E. Small | | a | | Clarkia borealis E. Small | | 477992 | |
| Clarkia borealis E. Small subsp. borealis | | a | i | Clarkia borealis E. Small subsp. borealis | | 477993 | |
| Clarkia borealis E. Small subsp. arida E. Small | | a | i | Clarkia borealis E. Small subsp. arida E. Small | | 477994 | |
| Clarkia biloba (Durand) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. biloba | | a | i | Clarkia biloba (Durand) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. biloba | | 484877 | |
| Clarkia biloba (Durand) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. brandegeeae (Jeps.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia biloba (Durand) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. brandegeeae (Jeps.) F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 484878 | |
| Clarkia biloba (Durand) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. australis F. H. Lewis & M. E. Lewis | | a | i | Clarkia biloba (Durand) A. Nelson & J. F. Macbr. subsp. australis F. H. Lewis & M. E. Lewis | | 484881 | |
| Clarkia concinna (Fisch. & C. A. Mey.) Greene subsp. concinna | | a | i | Clarkia concinna (Fisch. & C. A. Mey.) Greene subsp. concinna | | 484950 | |
| Clarkia concinna (Fisch. & C. A. Mey.) Greene subsp. automixa R. N. Bowman | | a | i | Clarkia concinna (Fisch. & C. A. Mey.) Greene subsp. automixa R. N. Bowman | | 484951 | |
| Clarkia concinna (Fisch. & C. A. Mey.) Greene subsp. raichei G. A. Allen et al. | | a | i | Clarkia concinna (Fisch. & C. A. Mey.) Greene subsp. raichei G. A. Allen et al. | | 484952 | |